尼帕病毒精准防控:NGS 技术筑牢感染防线

据媒体报道,近日印度西孟加拉邦发生尼帕病毒疫情,截至 1 月 23 日,共确诊了 5 例病例。我国尚无尼帕病毒病病例报告。

认识 “尼帕病毒

1. 病原学:尼帕病毒属于副粘病毒科(Paramyxoviridae)亨尼帕病毒属(Henipavirus)。病毒颗粒呈多形性,直径 150-300nm,最外层为脂蛋白包膜,核衣壳呈螺旋对称。2. 宿主及传播途径:天然宿主主要为果蝠。尼帕病毒主要通过以下方式传播到人:(1)直接接触被病毒感染的动物(如果蝠、猪、马等)或其体液(如血液、尿液、唾液等)。

(2)食用被病毒感染动物的体液、分泌物或排泄物所污染的食品(如被果蝠污染的水果)。

(3)密切接触被病毒感染的病人或其体液(包括鼻咽分泌物、尿液或血液等)。尼帕病毒病人际间传播主要发生在病例家庭和医疗机构。

(4)有气溶胶传播的文献报道。

3. 易感人群:

人对尼帕病毒普遍易感,特别是生猪养殖场或肉类加工厂从业人员等职业暴露人群是感染的高风险人群。

感染严重性

尼帕病毒感染的严重性体现在临床表现隐匿性强和致死率高特征。一是临床表现多样,隐匿性强。根据 WHO 报告,尼帕病毒感染的潜伏期(从感染到出现症状的时间间隔)为 4~14 天,最长可达 45 天。初期初期症状与流感相似,表现为发热、头痛、肌痛、咽痛、呕吐等症状,随后可快速进展为病毒性脑炎,导致嗜睡、定向障碍、抽搐、昏迷;或引发急性呼吸窘迫综合征,出现严重呼吸困难;二是病死率高,人感染尼帕病毒病死率可高达 40%-75%。

鉴于缺乏有效治疗手段,早期发现、隔离病例、追踪接触者以及加强感染控制措施是防控的关键。

感染患者早期精准快速诊断

在应对尼帕病毒这类新发、高对人类健康危害严重的,早期识别、精准诊断和科学防控是应对的关键。杰毅 Q-mNGS 技术,检测范围覆盖 35257 种病原微生物,可在 13 小时内快速检测、精准鉴定罕见、新发病原体,完成从样本到报告的流程,为传染病的精准鉴别、快速诊断提供关键技术支撑。

新发突发传染病实时监测和预警

SSR-mNGS 是杰毅病原宏基因组数据分析软件 (MS003) 是杰毅生物自主研发的病原宏基因组数据分析系统,具备强大的分析能力,致力于提供快速、精准的微生物鉴定服务。该软件包含病原宏基因组分析、极速分析、进化分析三大功能模块,满足客户多元化微生物鉴定和学术研究需求,同时可助力搭建传染病实时监测和预警平台。

公众如何防护?

目前,尚无针对尼帕病毒病的特异性抗病毒药物和获批上市的疫苗,采取有效的预防措施至关重要:避免接触潜在传染源:避免接触蝙蝠,尤其是果蝠及其分泌物、排泄物,不要食用蝙蝠可能接触过的食物或水源。

加强家畜管理:对养猪场等家畜饲养场所进行定期消毒,防止蝙蝠粪便等污染物进入饲料或水源。

加强个人防护:非必要不前往尼帕病毒病流行地区;确需前往的,应做好个人防护,避免接触野生动物、病死动物及可疑污染物;严禁生食或饮用未经处理的生鲜食品和饮品;在处理可能受尼帕病毒污染的物质时,应佩戴手套、口罩和防护服,避免直接接触。

及时就医:如在疫区旅居或有可疑接触史后出现发热、头痛、等症状,应立即前往医疗机构就诊,并主动告知医生相关流行病学史,以便及时诊断和治疗。

 

权威认证+1 | 杰毅生物高分通过 tNGS 室间质评

近日,上海市临床检验质量控制中心公布了 2025 年度下呼吸道感染病原体 tNGS(靶向二代测序)检测室间质量评价结果。经过严格评审,杭州杰毅医学检验实验室在本次室间质评中高分通过,检测能力再获权威认可!

tNGS 技术聚焦特定症候群病原体,具有检测周期短、灵敏度高、特异性强等优势,尤其适用于下呼吸道感染病原体的精准识别。本次室间质评聚焦常见及高致病性的呼吸道感染病原体,通过假阳性、假阴性及稳健性结果三大核心维度,评估参评实验室 tNGS 检测性能的特异性、灵敏度与稳定性。
面对广大医疗机构本地化开展病原体 NGS 检测需求,杰毅生物推出 SeqPlex®tNGS 系列,涵盖泛感染、呼吸、中枢、生殖道、TB 等症候群感染 tNGS 检测。凭借高度自动化的检测平台与严格的实验室质量管理体系,杰毅生物自 2022 年起,已连续三年以优异成绩通过国家卫健委临床检验中心、上海临床检验质量控制中心、广东省临检中心组织的多项室间质量评价,这些权威认可充分验证了杰毅Q-mNGS®、SeqPlex®tNGS 技术方案的可靠性与检测专业能力。

每一份室间质评的高分成绩,不仅是肯定,更是一份敦促我们持续精进的责任。杰毅生物始终秉持初心,践行 “让每位感染患者第一时间获得精准诊疗” 的使命。未来,我们将继续提升检测能力的专业性、精准性与可靠性,致力于成为感染精准诊断领域最值得信赖的合作伙伴。

实力认证!杰毅生物全面通过下呼吸道、血液、中枢神经系统感染 mNGS 室间质评

近日,广东省临床检验中心公布了广东省 2025 年下呼吸道感染、血液微生物 cfDNA、中枢神经系统感染宏基因组高通量测序室间质评结果。杰毅生物旗下杭州杰毅医学检验实验室以高分成绩顺利通过以上三项室间质评!

01. 下呼吸道感染病原体 mNGS 室间质评

本次预研活动从检测分析敏感性、特异性、重复性及稳健性等多个方面考核了省内临床实验室应用 mNGS 技术检测下呼吸道标本中病原微生物的能力。总体而言,各实验室的检测流程差异显著,对多数常见病原体的检测能力较好,但对特殊结构微生物的检出能力、生信分析精准度及流程稳定性仍需重点提升。

本次接受报名的实验室 33 家,实际收到 31 家有效回报结果。如下图所示,31 家实验室所得成绩分布如下:

  • 90~99 分(含 90 分)的实验室 19 家;
  • 80~89 分(含 80 分)的实验室 8 家;
  • 低于 80 分(不含 80 分)的实验室 4 家。

按照≥80 分为合格的标准,合格率为 87.0%(27/31)。

02. 血液微生物 cfDNA mNGS 室间质评

本次预研活动从检测结果的准确性、稳健性、重复性以及报告解读等多个方面考核了 mNGS 实验室检测血浆微生物 cfDNA 诊断感染性疾病的能力。各实验室的检测流程差异较大,整体检测能力较好,但不同实验室间差异能力较大,菌株鉴定能力仍需提高。

本次接受报名的实验室共 32 家,实际收到 30 家有效回报结果。如下图所示,基于评分方法,30 家实验室所得成绩分布如下:

  • 100 分的实验室 1 家;
  • 90~99 分(含 90 分)的实验室 10 家;
  • 90~80 实验室有 13 家;
  • 低于 80 分的实验室共 6 家。

按照≥80 分为合格的标准,合格率为 80%(24/30)。

03. 中枢神经系统感染 mNGS室间质评

本次预研活动从检测分析敏感性、特异性、重复性及稳健性等多个方面考核了省内临床实验室应用 mNGS 技术检测中枢神经系统感染(脑脊液)病原体的能力。总体而言,各实验室对多数常见细菌、真菌及 DNA 病毒的检测能力较好,总体合格率达 100%,但对低载量 RNA 病毒的敏感性、背景污染的控制能力及检测流程的稳定性仍需重点提升。

本次接受报名的实验室 31 家,实际收到 29 家有效回报结果。如下图所示,基于评分方法,29 家实验室所得成绩分布如下:

  • 100 分的实验室 14 家;
  • 90~99 分(含 90 分)的实验室 15 家。

按照≥90 分为合格的标准,合格率为 100%(29/29)。

聚焦临床疑难、复杂感染患者病原诊断的难题与挑战,杰毅生物持续推动 mNGS 检测技术及应用的标准化升级,公司自 2020 年推出的 Q-mNGS™定量宏基因组检测,经过技术优化升级,实现病原体检测性能的多维度提升:
1. 通过正向广谱富集技术,高效富集血浆样本中低载量病原体核酸,显著提升检测灵敏度。

2.NGSmaster™全自动一站式建库仪采用 PCR-free 建库方案,从实验流程中最大程度降低病原体核酸污染风险。

3. 覆盖 35257 种病原体及 60 种耐药基因、78 种毒力基因的高质量数据库,确保罕见病原体检出,CNV 分析特异性提示肿瘤信号,提升感染、肿瘤鉴别诊断效能。

4. 基于 50w 检测大数据,建立病原体分级、分类汇报原则,结合 AI 智能化生信分析,13 小时完成报告,实现病原体精准、快速鉴别,让 mNGS 检测更加契合临床所需。

凭借高度自动化的检测平台与严格的实验室质量管理体系,杰毅医学检验实验室自 2022 年起已连续 3 年以优异成绩通过国家卫生健康委临床检验中心组织的全国下呼吸道感染、血液微生物 cfDNA、中枢神经系统感染宏基因组高通量测序等项目以及上海临床检验质量控制中心组织的血浆微生物游离 DNA 基因组高通量测序室间质评等项目,充分验证了杰毅生物 Q-mNGS 技术方案及检测能力的专业度。

每一份室间质评高分成绩,既是认可,更是我们持续精进的责任。杰毅生物始终坚守初心和愿景——让每位感染患者第一时间得到精准诊疗。未来,我们将继续追求更专业、更精准、更可靠的检测能力,致力于成为感染精准诊断领域最值得信赖的合作伙伴。

流感样病例数创近四年新高,混合感染风险激增

流感警报,全国多地拉响

最近,全国的流感阳性率均保持高位。多地学校停课,感染范围扩大,流感警报正在全国多地拉响!

先看国家疾控中心发布的三个关键信息:第一,全国已有 17 个省份进入流感高流行状态;第二,今年的疫情势头已超过去三年同期;第三,这波高峰,还在继续攀升。

图 1:2022-2026 年度中国南方、北方省份哨点医院流感样病例(来源:中国疾病预防控制中心

图中 4 条不同颜色的曲线,分别代表 4 个监测年份的数据。监测一般自每年第 14 周(约 3 月中旬)开始。其中,绿色曲线为 2022-2023 年数据,红色曲线为当前监测年(2025-2026 年)数据。
无论是南方(图 1)还是北方(图 2),截至第 48 周(约 11 月底),代表今年的红色曲线均已明显高于其他年份同期水平,当前流感流行强度已创下近年新高。
从杰毅生物流感病毒检测频率统计可见,2025 年 10 月以来流感病毒检出频率呈现升高趋势,截至 12 月初检出率已接近 2024 年最高水平。

图 2. 杰毅生物甲型流感病毒检出频率

甲流 H3N2,关注高危人群并发症

根据国家疾控中心数据,甲型 H3N2 亚型流感病毒仍然占流行优势,占比超过 95%,有少量甲型 H1N1 和乙型流感病毒同期流行。甲型流感病毒感染病例中,5~14 岁病例组检测阳性率明显高于其他年龄组。

重点人群和高风险人群包括:60 岁及以上的老年人,罹患一种或多种慢性病患者,养老机构、长期护理机构、福利院等聚集场所的居住人员和员工,孕妇,6 月龄到 5 岁儿童,6 月龄以下婴幼儿的家庭成员和看护人员,托幼机构、中小学校、医疗机构、监管场所等重点场所人群。

WHO 明确界定的流感高危人群,其并发症发生率和死亡率远高于普通人群,具体差异如下:

多种病毒混合感染,警惕重症

今年的呼吸道传染病流行呈现出多病原共循环的复杂态势。除了流感病毒外,呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒等多种病原体也处于活跃状态。临床上,部分患者在短期内可能连续感染不同病原体,也有病例出现甲型与乙型流感病毒的混合感染。

图 3. 哨点医院门急诊流感样病例呼吸道样本病原体核酸检测阳性率每周变化趋势

图 4. 杰毅生物呼吸道 RNA 病毒检出趋势

混合感染会引发更强烈的全身炎症反应,导致肺部损伤加重,显著增加重症肺炎、呼吸衰竭的发生风险。美国 CDC2024 年报告指出,H3N2 与新冠共感染的住院患者中,近三成发展为重症。在当前多种呼吸道病毒共同流行的季节,我们更应提高警惕,做好科学防护,降低混合感染、重症感染的发生可能。

精准快速病原体检测、实时监测方案

呼吸道传染病的高发期,病原体检测数据对疾病预防和治疗至关重要。为医疗机构 NGS 本地化运营打造的 “毅达 Lab” 数智化实验室信息系统,引入 AI 智能审核,确保每一份报告的及时性和准确性。多维度数据看板则将复杂数据转化为清晰洞察,可实时掌握病原动态,精准预警潜在风险,真正实现病原数据的可知、可控、可预测。

面对混合、重症呼吸道感染,一次性精准筛查数百种常见流行病原体的 tNGS 技术,成为明确病因的高效检测方法。杰毅生物 SeqPlex®tNGS 呼吸采用多重扩增酶切法建库, 对常见及重点关注的呼吸系统感染相关的 324 种病原核酸进行靶向扩增富集, 结合高通量测序技术, 实现对呼吸系统感染病原体广谱精准检测,助力临床提高诊断效率。

首批浙江省科技新小龙,杰毅生物光荣入选!

2025 年 12 月 1 日,首批 “浙江省科技新小龙企业” 名单正式公布。杭州杰毅生物技术有限公司凭借在感染性疾病分子诊断领域展现出的卓越实力和发展潜力,与全省 95 家新锐科技企业共同入选首批科技新锐企业名单。

为深入贯彻创新驱动发展战略,加快建设创新浙江,着力发展新质生产力,培育一批具有核心技术突破能力、引领产业变革的新锐科技企业,由浙江省科学技术厅、新华社浙江分社、浙江省经济和信息化厅、国家金融监督管理总局浙江监管局指导,省高新技术企业协会联合新华社新闻信息中心浙江中心、省创业投资协会、省银行业协会、《浙商》杂志社、新华网股份有限公司浙江分公司、省科技宣传教育中心、省科技成果转化联盟等共同开展 “浙江省科技新小龙探访和护航行动”。

在浙江省浓厚的创新氛围与多项精准扶持政策的加持下,杰毅生物深耕感染精准诊疗领域,针对临床感染性疾病病原检测的需求,构建了矩阵化的检测产品与服务体系,并持续创造新的里程碑。

2024 年,鹦鹉热衣原体核酸检测(PCR)试剂盒正式获批中国医疗器械三类证,该产品为全球首款获证的鹦鹉热核酸检测试剂盒,填补了行业空白。2025 年,公司进一步拓展产品布局,正式推出覆盖泛感染、呼吸、中枢、生殖、分枝杆菌等多症候群的 tNGS 系列产品,全方位满足住院感染诊疗需求;为本地化开展病原 NGS 检测的客户量身打造 “毅达 Lab” 病原体检测整体解决方案,兼具实验流程简化高效、检测结果精准可靠、综合成本更集约的核心优势,在行业内率先实现了 mNGS 检测特异性肿瘤提示的创新技术,助力更多医疗机构落地优质高效的本地化病原 NGS 检测,充分释放技术产业化与市场拓展的巨大潜力。

专为医疗机构 NGS 地化运营打造的 “毅达 Lab” 数智化实验室信息系统,创新引入 AI 智能审核机制,全程保障每一份报告的及时性与准确性;多维度数据看板更能将复杂数据转化为直观洞察,支持实时掌握病原动态、精准预警潜在风险,真正实现病原数据的可知、可控、可预测。

杰毅生物将依托浙江省科技新小龙探访和护航行动的指导和赋能,进一步加大病原 NGS 检测、AI 数智化实验室系统等核心技术产品的开发与迭代力度并加速技术成果市场化落地,持续为医疗卫生机构输出更精准、更智慧的病原诊断解决方案,以技术革新打破行业现有瓶颈,为行业注入持续的技术创新动能。

标准之上,精准可及:毅达 Lab 全流程方案助推 NGS 检测规范化落地

11 月 21-23 日,由中国医学装备协会基因检测分会主办,吉林大学第一医院协办的 “第三期全国病原体高通量测序临床规范化应用培训研讨班” 在吉林省长春市成功举办,逾 300 名全国临床医学、检验等领域专家骨干参与。

本次培训延续了前两届的高水准和专业性,紧扣"临床规范化应用"这一核心主题,围绕 mNGS 临床应用阈值设定、tNGS 技术优化、实验室质量控制、检测结果临床解读等热点议题展开深度授课及学术研讨。培训期间,杰毅生物携 “毅达 Lab” 病原体检测整体解决方案与参会专家、技术骨干们进行了深度交流。

随着病原体 NGS 检测技术日渐普及,管理政策与行业标准指南形成合力,推动病原体 NGS 检测向标准化、规范化发展。当病原 NGS 检测从中心实验室走向分布广泛的各级医疗机构,在项目开展中依旧面临诸多难题:实验端操作流程复杂冗长,需要专业实验人员长时间操作;实验全流程需要完备的质量控制、污染防控作为保障;生信分析环节高度依赖专业生信分析人才,对技术团队的专业储备要求严苛;成本控制方面,还需妥善平衡样本量规模与检测时效性之间的核心需求等。
基于过去 5 年在 NGS 领域的临床实践和探索,通过自动化实验流程、智能化分析系统的持续优化升级,杰毅于 2025 年正式推出了更容易落地开展的本地化 NGS 解决方案——“毅达 Lab” 病原体检测整体解决方案:

毅达 Lab 病原体检测整体解决方案

结果精准:1. 定量病原检测:通过分子内标实现病原体相对定量分析,为临床评估感染程 度,监测疗效提供关键支持,让报告更具临床指导价值;

2. 肿瘤信号提示:CNV 分析特异性提示肿瘤信号,为不明原因发热鉴别诊断提供新的诊断思路;

3. 全方位防污染体系:从实验分区、UDG 酶、质控品共上机、干实验分析等环节降低污染风险。

落地可及:

1. 创新建库:多重扩增酶切法建库,易操作,日间交付提高时效;

2. 自动化建库设备+智能化生信分析:AI 辅助判读结果,降低分析门槛,提高报告交付效率;

3. 灵活适配主流测序平台,满足实验室部署要求。

成本集约:

1. 支持 mNGS+tNGS 等项目并线上机,极大提升单次测序的通量与效率,实现 “一机多用”,单次检测成本灵活可控;

2. 创新的建库技术不仅提升了检测性能,更显著节省了试剂耗材与人工投入,灵活满足大型中心实验室、大型三级医院、地市级医院等不同规模医疗机构运行所需。

面对广大医疗机构本地化开展病原体 NGS 检测需求,杰毅生物推出 SeqPlex®tNGS 系列,涵盖泛感染、呼吸、中枢、生殖道、TB 等症候群感染 tNGS 检测,Q-mNGS®定量 mNGS 检测,满足住院感染患者多维度精准检测需求。

SeqPlex® tNGS 检测

1. 拓展物种覆盖能力:基于真实检测数据,增加临床关注物种数量,显著提升覆盖范围。

2. 科学优化病原体选择:依据专家共识、诊疗指南,结合杰毅 50w+检测大数据,确保每个物种在对应症候群和样本类型中均有明确临床价值。

3. 更契合临床的报告展示:严格遵循权威指南,对检出微生物进行了致病性分级,使结果汇报更科学、严谨,为临床判读提供关键依据。

Q-mNGS® 定量 mNGS 检测

  1. 双文库策略:常规文库及高敏文库双文库构建解决微生物及宿主含量对灵敏度的制约。
  2. 一次检测,双重获益:鉴定感染病原体的同时,发现患者潜在的肿瘤风险。
  3. 引入分子内标,还原真实病原结果:协助临床监控病原体的载量变化和病程管理。

凭借病原 NGS 检测领域丰富的产品开发和项目运行经验,杰毅生物已经与 2000 余家医疗机构合作,积累了 50w 临床标本大数据,并连续三年多次以优异成绩通过全国中枢神经系统感染、血液微生物 cfDNA、下呼吸道感染 mNGS 室间质评。未来杰毅将携手广大医疗机构,共同推动病原体 NGS 检测向标准化、精准化方向前行。

突破 FUO 诊疗困境,杰毅 Onco-mNGS 肿瘤提示科研文章合集(二)

不明原因发热(FUO)病因复杂,诊断困难,约半数患者难以确诊,其中约 14% 为恶性肿瘤,且死亡率高达 12-35%。由于初诊常优先考虑感染,肿瘤易被忽视,导致误诊。

为实现感染与肿瘤的早期精准鉴别,杰毅生物基于 50 万临床数据,率先推出 Onco-mNGS 技术。该技术在一次检测中,既能鉴定病原体,又能通过染色体拷贝数变异(CNV)分析提示肿瘤信号,为 FUO 诊疗提供了高效新方案。为验证其诊断性能,杰毅生物自 2021 年起联合全国多家医院开展了临床研究,以下是相关成果及病例报告。

1. 期刊:《Frontiers in Medicine》(2021 IF=5.06)

合作单位:苏州大学附属第一医院

Diffuse Large B-Cell Lymphoma of the Mandible Diagnosed by Metagenomic Sequencing: A Case Report研究概述:本文报告一例 52 岁女性患者的下颌骨 DLBCL,并伴有复发性发热和牙痛,根据 Q-mNGS 结果排除了微生物感染。另外,通过对人源核酸序列进行分析,发现患者的染色体拷贝数异常,由此推测患有癌症。Q-mNGS 通过检测 CNV,可促进临床对肿瘤的关注,有助于对肿瘤的早期诊断。结合病原检测和 CNV 分析,Q-mNGS 可提供多层次的诊断线索,有助于优化肿瘤诊断的敏感性,对疑似感染的患者鉴别诊断具有重要意义。

关键词:拷贝数变异;弥漫性大 B 细胞淋巴瘤;不明原因发热;下颌骨非霍奇金淋巴瘤;宏基因组二代测序;非霍奇金淋巴瘤

2. 期刊:《BMC Pulmonary Medicine》 (2022 IF=3.10) 

合作单位:福建中医药大学第二附属医院

Diagnosis of lung squamous cell carcinoma based on metagenomic Next-Generation Sequencing

研究概述:临床对疑似肺部感染患者的治疗常依赖经验性抗生素。但初步诊断多基于临床表现和常规微生物检测,其结果可能存在误判。本例患者初诊为肺脓肿,但抗生素治疗无效,经宏基因组二代测序(mNGS)提示存在恶性肿瘤。经肺活检组织 HE 染色及免疫组化检测,该患者最终被确诊为肺鳞状细胞癌。

关键词:拷贝数变异;肺脓肿;肺鳞状细胞癌;宏基因组二代测序;肺部感染

3. 期刊:《Oncology Letters》(2023 IF=2.50)

合作单位:贵州省人民医院

T-lymphoblastic lymphoma in a child diagnosed by metagenomic sequencing: A case report

研究概述:

患者为一名 8 岁男孩,因出现腹痛、胸闷和呼吸困难超过 5 天就诊,并考虑双侧胸膜、腹部和心包积液。初期诊断为感染,但抗炎药物无效,且积液标本的细胞学和肿瘤标志物分析未发现异常。后心包积液送检 mNGS,未检出病原体,但 CNV 提示肿瘤。该患者最终诊断为 T 淋巴细胞淋巴瘤。

关键词:

T 淋巴母细胞淋巴瘤;拷贝数变异;宏基因组二代测序;多浆膜腔积液;非霍奇金淋巴瘤

4. 期刊:《Frontiers in Immunology》2023 IF=5.70 

合作单位:首都医科大学附属北京友谊医院

Etiological stratification and prognostic assessment of haemophagocytic lymphohistiocytosis by machine learning on onco-mNGS data and clinical data

研究概述:

本研究基于 Onco-mNGS 产生的 CNV 和微生物数据,对 92 例经临床确诊的噬血细胞性淋巴组织细胞增多症(HLH)患者进行了感染、肿瘤和自身免疫的病因学分型,并建立和验证了一个可用于鉴别诊断导致继发性 HLH 病因的预测模型,最后评估了 EBV 感染和非 EBV 感染导致的 HLH 患者的治疗效果。结果表明,Onco-mNGS 可用于识别继发性 HLH 患者的感染和恶性肿瘤相关诱因。基于 CNV 信息、感染病原体谱和血液微生物群落建立的随机森林分类模型可用于鉴别不同的 HLH 亚型并确定其潜在的诱发因素。HLH 患者的治疗预后不仅与 CNV 有关,还与外周血中的病原和非病原微生物有关。高 CNV 负担以及 19 号染色体上的频繁缺失、高病原载量和低非病原微生物载量等预后因素与患者的不良预后结局呈显著相关。该研究为继发性 HLH 患者的诱因和预后预测提供了全面的认识,Onco-mNGS 有助于早期诊断和适当的靶向治疗,从而改善患者的生存和预后。

关键词:

病因学分型;噬血细胞性淋巴组织细胞增多症;机器学习;Onco-mNGS;预后评估

 

5. 期刊:《International Journal of General Medicine》(IF=2.0)

合作单位:福建中医药大学附属人民医院

Clinical Application and Evaluation of Metagenomic Next-Generation Sequencing for Lower Respiratory Tract Infections and Human Tumor Screening

研究概述

本研究旨在评估 mNGS 在下呼吸道感染(LRTIs)与人类肿瘤筛查中的临床价值。收集 2020 年 1 月至 2022 年 9 月收治的 188 例患者的样本(包括支气管肺泡灌洗液、痰液、肺活检组织及外周血),采用 mNGS 技术同步进行病原体与染色体拷贝数变异(CNV)检测,同时进行传统微生物培养和综合微生物检测(CMT),比较三种方法(mNGS 组、传统培养组与 CMT 组)的诊断效能。结果表明,188 例患者中,LRTIs 组 149 例(79.3%),非 LRTIs 组 39 例(20.7%)。mNGS 组的诊断敏感度与准确度均高于传统培养组和 CMT 组(P < 0.001;P < 0.001;P < 0.001;P < 0.001),特异性高于 CMT 组(P = 0.039)但低于传统培养组(P = 0.006)。mNGS 组与传统培养组的阳性预测值均高于 CMT 组(P = 0.004;P = 0.011),mNGS 组的阴性预测值高于 CMT 组(P = 0.003)。此外,所有样本同步进行染色体 CNV 检测,8%(15/188)呈现 CNV 阳性。其中 10 例患者初诊被误诊为非肿瘤性疾病,误诊率达 66.7%(10/15)。对 13 例确诊原发性或转移性肺癌患者进行 BALF CNV 检测,阳性率为 38.5%。本研究表明,mNGS 技术在病原学诊断中的敏感度与准确度优于传统培养和 CMT 检测。CNV 检测是肿瘤尤其是隐匿性肿瘤筛查的重要辅助诊断手段。

关键词:

基因组不稳定性;宏基因组学;二代测序;病原学诊断;呼吸道感染性疾病

总结

这些研究共同印证了 Onco-mNGS 技术在不明原因发热患者中感染和肿瘤排查中作用显著,检测性能优异。mNGS 正从单一的 “感染诊断工具” 演变为 “病原微生物与肿瘤联合检测的新方案”。未来有望建立多癌种大数据模型,探索肿瘤、遗传学领域,借助 AI 优化数据分析、推动多方法联用,助力临床精准诊疗。

基于 “毅达 Lab” 病原体检测整体解决方案,NGS 本地化用户不仅可以选择 mNGS 和 tNGS 并线上机,更能灵活拓展 Onco-mNGS 检测,实现精准快速病原检测+肿瘤提示双重获益,让 NGS 本地化开展提质增效。

呼吸道合胞病毒与流感双重威胁,重点人群如何应对感染风险?

呼吸道传染病高发季

根据国家疾控中心最新监测数据,我国已进入呼吸道传染病高发季节,流感活动逐步进入快速上升阶段,肠道病毒、鼻病毒和呼吸道合胞病毒等也存在一定水平活动。

表 1. 第 44 周呼吸道样本主要病原体核酸检测阳性率区域差异

 
南方省份包括:上海、江苏、浙江、安徽、福建、江西、湖北、湖南、广东、广西、海南、重庆、四川、贵州和云南。
北方省份包括:北京、天津、河北、山西、内蒙古、辽宁、吉林、黑龙江、山东、河南、西藏、陕西、甘肃、青海、宁夏、新疆和新疆生产建设兵团

近期活跃的呼吸道合胞病毒、流感病毒有哪些新的动向,哪些人群需要重点防护?

呼吸道合胞病毒,幼儿混合感染危害重

近期,呼吸道合胞病毒(RSV)检测阳性率仍处高位波动,北方省份呈上升趋势、南方省份波动下降。杰毅生物 RSV 检出频率显示,今年秋季 RSV 检出频率显著高于去年同期水平。

图 1. 杰毅生物呼吸道合胞病毒检出频率

呼吸道合胞病毒是一种主要影响婴幼儿呼吸道的病毒,是婴儿病毒感染死亡的第二大常见原因。数据显示,0-4 岁幼儿是 RSV 感染率最高的年龄段。尤其在我国南方省份,该年龄组的 RSV 阳性率持续高于其他年龄组。RSV 混合感染往往导致病程延长、病情加重。浙江省疾控中心一项针对 7857 名 RSV 住院患儿的研究显示,约有 20.4% 的患儿存在混合感染。细菌合并感染病例中,肺炎支原体是主要病原体(59.2%),其次是肺炎链球菌(25.3%)和流感嗜血杆菌(8.8%)。在病毒合并感染病例中,人类鼻病毒是最常检测到的病原体,占 27.3%,其次是巨细胞病毒(23.8%)和人类腺病毒(14.0%)。

重症呼吸道合胞病毒感染可导致严重并发症,包括心血管及神经系统并发症,包括心力衰竭、脑炎等。越来越多的研究从不同角度揭示,婴儿期呼吸道合胞病毒感染可对呼吸系统带来损伤,甚至持续到成年时期。如患儿出现严重症状,如呼吸急促、呼吸困难和持续高烧不退,应及时就医,及早诊断,避免延误治疗。

杰 Sir TIPS:

1. 目前国内外尚无用于婴儿的针对 RSV 感染的疫苗上市。我国目前批准了 RSV 单克隆抗体,通过被动免疫方式来保护婴幼儿降低感染风险。

2. 当患者出现呼吸急促、费力、嘴唇发绀、体温达 38.5℃持续不退,精神萎靡、不吃不喝等症状,请及时就医。

流感来袭,新毒株传播范围更大

根国家疾控中心第 44 周流感监测周报,近期流感活动上升明显,绝大多数省份都已进入流感流行期。从杰毅生物流感病毒检测频率统计可见,今年 10 月以来流感病毒检出频率呈现升高趋势。

图 2. 杰毅生物流感病毒病毒检出频率

今年流感在南方省份活动明显增强,区别于去年的甲型 H1N1,今年流行毒株以甲型 H3N2 为主。这意味着,由于我国人群对 H3N2 的免疫背景相对薄弱,病毒将更容易传播,可能造成比往年更大范围的感染,公众需格外重视并做好防护。

表 2. 流感样病例监测实验室检测结果

H3N2 与 H1N1 流感病毒感染所引起的症状高度相似,均表现为典型流感综合征,核心症状包括:高热(体温常超过 39°C)、明显乏力、全身肌肉酸痛、头痛、咳嗽及喉咙痛。部分患者(尤其在儿童群体中)也可能出现胃肠道症状,如恶心、呕吐或腹泻。尽管临床症状相近,两者在流行病学与重症特征上存在差异。《柳叶刀》一项基于十年数据的研究显示,在 H3N2 主导的流行季,总体住院率更高;而因甲型 H1N1pdm09 住院的患者,病情进展风险更大,其入住 ICU 或接受机械通气/体外膜肺氧合(ECMO)治疗的比例更高。

从易感人群来看,H1N1 在年轻成人及肥胖患者中引发重症的风险较高;H3N2 则对老年人与儿童的影响更为显著。研究显示儿童感染 H3N2 后,除高热外,发热持续时间可能更长,且更易继发支气管炎、肺炎等并发症。

杰 Sir TIPS:
1. 接种流感疫苗是最有效的预防措施之一,三价和四价流感疫苗均覆盖所有流行的季节性流感病毒的型别和亚型。
2. 出现高热、肌肉酸痛等典型症状请及时就医,及早诊断和治疗,在症状出现 48 小时内进行抗病毒药物治疗效果最佳,注意:服用抗生素对流感病毒无效,须在医生指导下使用抗病毒药物。

杰毅生物精准快速病原体检测、实时监测方案

呼吸道传染病的高发期,多种病原体共循环已成为新常态。发热、咳嗽等症状的病因复杂多样。常规检测方法难以覆盖全部病原体,极易造成漏检。一次性精准筛查数百种常见流行病原体的 tNGS 技术,成为明确病因的高效检测方法。杰毅生物 SeqPlex®tNGS 呼吸采用多重扩增酶切法建库, 对常见及重点关注的呼吸系统感染相关的 324 种病原核酸进行靶向扩增富集, 结合高通量测序技术, 实现对呼吸系统感染病原体广谱精准检测,助力临床提高诊断效率。

为医疗机构 NGS 本地化运营打造的 “毅达 Lab” 数智化实验室信息系统,引入 AI 智能审核,确保每一份报告的及时性和准确性。多维度数据看板则将复杂数据转化为清晰洞察,可实时掌握病原动态,精准预警潜在风险,真正实现病原数据的可知、可控、可预测。